La microbiologia è una branca della biologia che studia la struttura e le funzioni dei microrganismi, cioè di tutti quegli organismi viventi unicellulari, pluricellulari o acellulari, non visibili ad occhio nudo: Batteri, Funghi, Lieviti, Protozoi, Virus e Prioni sebbene questi non siano classificati come esseri viventi in senso stretto.

La cavità orale è popolata da circa 300 microrganismi opportunisti perfettamente adattati all’ambiente dove vivono come commensali sono generalmente poco o affatto virulenti, ma possono diventare patogeni approfittando di una condizione di minor resistenza dell’organismo ospite o di una risposta immunitaria deficitaria